场景描述

本文介绍基于阿里云批量计算服务、Cromwell、 GATK和工作流定义语言(WDL)描述的基因组数据分析流程,进行基因分析的最佳实践。

解决的问题

搭建以Cromwell为基因测序工作流管理平台,使用批量计算服务提供基因测序计算集群,运行以WDL定义的基因测序流程的云端基因测序平台。

部署架构图

BCS Cromwell基因测序

选用的产品

  • 访问控制

    RAM 使您能够安全地集中管理对阿里云服务和资源的访问。您可以使用 RAM 创建和管理用户和组,并使用各种权限来允许或拒绝他们对云资源的访问。

    更多关于访问控制的介绍,参见访问控制产品详情页

  • 云服务器ECS

    云服务器(Elastic Compute Service,简称ECS)是阿里云提供的性能卓越、稳定可靠、弹性扩展的IaaS(Infrastructure as a Service)级别云计算服务。云服务器ECS免去了您采购IT硬件的前期准备,让您像使用水、电、天然气等公共资源一样便捷、高效地使用服务器,实现计算资源的即开即用和弹性伸缩。阿里云ECS持续提供创新型服务器,解决多种业务需求,助力您的业务发展。

    更多关于云服务器ECS的介绍,参见云服务器ECS产品详情页

  • 批量计算

    批量计算(BatchCompute)是一种适用于大规模并行批处理作业的分布式云服务。BatchCompute可支持海量作业并发规模,系统自动完成资源管理,作业调度和数据加载,并按实际使用量计费。BatchCompute广泛应用于电影动画渲染、生物数据分析、多媒体转码、金融保险分析、科学计算等领域。

    更多关于批量计算的介绍,参见批量计算产品详情页

  • 专有网络VPC

    专有网络VPC帮助您基于阿里云构建出一个隔离的网络环境,并可以自定义IP 地址范围、网段、路由表和网关等;此外,也可以通过专线/VPN/GRE等连接方式实现云上VPC与传统IDC的互联,构建混合云业务。

    更多关于专有网络VPC的介绍,参见专有网络VPC产品详情页

  • 对象存储OSS

    阿里云对象存储服务(Object Storage Service,简称 OSS),是阿里云提供的海量、安全、低成本、高可靠的云存储服务。其数据设计持久性不低于 99.9999999999%(12 个 9),服务设计可用性(或业务连续性)不低于 99.995%。

    更多关于对象存储OSS的介绍,参见对象存储OSS产品详情页

  • 云数据库RDS

    阿里云关系型数据库(Relational Database Service,简称RDS)是一种稳定可靠、可弹性伸缩的在线数据库服务。基于阿里云分布式文件系统和SSD盘高性能存储,RDS支持MySQL、SQL Server、PostgreSQL、PPAS(Postgre Plus Advanced Server,高度兼容Oracle数据库)和MariaDB TX引擎,并且提供了容灾、备份、恢复、监控、迁移等方面的全套解决方案,彻底解决数据库运维的烦恼。

    更多关于云数据库RDS的介绍,参见云数据库RDS产品文档

  • 容器镜像服务ACR

    提供安全的镜像托管能力,稳定的国内外镜像构建服务,便捷的镜像授权功能,方便用户进行镜像全生命周期管理。

    更多关于容器镜像服务ACR的介绍,参见容器服务 ACR产品详情页

详细信息

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