使用阿里云批量计算服务优化的WDL-Canu方案高效、经济地进行三代基因组装。

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场景描述

本文介绍如何基于批量计算服务提供的WDL- Canu解决方案，进行三代基因组组装的最佳实践。

解决的问题

  • 不更改Canu的使用习惯，基于云基础设施环境在云端进行三代组装。
  • 充分利用云端基础设施弹性、灵活的优势。
  • 以Workflow Description Language（WDL）优化重构Canu工作流。
  • 根据Canu全流程中的不同任务，批量计算启动适配任务需求的弹性伸缩集群大幅提高资源利用率及组装效率。

部署架构图

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