利用容器服务Kubernetes版中的工作流机制,配合共享存储NAS完成基因计算。
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场景描述
适合利用容器服务Kubernetes版上的工作流引擎进行大规模基因测序的场景。阿里云工作流引擎基于开源项目Argo实现,支持并发、循环、 重试等多种执行策略。典型的基因计算过程会把数据分批进行计算,按照规定好的步骤依次完成计算,这符合工作流的特点:多层次和有向无环图。
解决的问题
- 基因计算如何构建工作流。
- 容器服务Kubernetes版结合共享文件存储NAS提供数据服务。
- 构建单Pod工作流。