生命科学选型最佳实践

本文介绍阿里云云服务器ECS在生命科学中的产品优势、解决方案架构等，让您了解生命科学企业业务上云的解决方案，如何通过云上HPC助力行业提升生产效率，降低生产成本。

中国的生命科学行业正迎来发展的黄金时期。医学的发展和人们对健康的追求，正快速转换为生命科学整个产业链发展的新动能。而生命科学的研究早已离不开高性能计算（High Performance Computing，HPC）的辅助，从蛋白质结构中的应用辅助药物设计、疫苗研发，到生物信息学中的应用辅助基因数据处理与分析，再到提供精准医疗服务于肿瘤治疗、产前筛查等医疗技术，高性能计算HPC在生命科学研究中扮演着十分重要的角色。

同时，随着人工智能（Artificial Intelligence，AI）技术的兴起，高性能计算HPC中逐渐出现了AI for Science，HPC+AI极大提升了生命科学领域的计算效率，随着生命科学行业的研究问题越来越复杂，加上AI的不断投入，传统IT也愈发难以满足生命科学行业的日益保障的算力需求。

因此，生命科学企业上云已经成为新的趋势。云上HPC以全新形式提供海量丰富的计算资源和高效便捷的数据服务，在研发流程的统一管理和IT成本优化等方面具有传统模式不可比拟的优势，可以极大地缩减计算时间、提升研发效率，能够更好地帮助生命科学企业赢得机会。本文将解读生命科学企业业务上云的解决方案，通过云上HPC助力行业提升生产效率，降低生产成本。

针对生命科学行业的痛点，阿里云弹性高性能计算E-HPC提供面向生命科学行业的一整套端到端解决方案，协助生命科学行业用户快捷上云有效解决线下IDC算力固定、规模固定、容量固定、配置固定、周期长、运维成本高的痛点。更多生命科学行业解决方案，请参见生命科学行业最佳实践。

生命科学行业架构说明

阿里云提供多种生命科学行业解决方案架构，包括公共云解决方案、混合云解决方案、容器化解决方案等。更多生命科学行业架构方案，请参见生命科学行业最佳实践。

公共云解决方案

业务全量部署在云端，依托阿里云E-HPC提供全链路服务与支持，集群的所有节点均为云上资源，并处于同一个VPC，也可以通过阿里云的云企业网打通多个VPC。

混合云解决方案

按照资源管理节点所在位置可分为两个模式：管理节点在云上或云下。适用场景：拥有线下IDC数据中心，但算力偏旧，随着业务的快速增长，企业希望可以使用云上算力同时利旧IDC。

HPC+AI高性能容方案

针得益于容器化技术跨平台运行的特性，不少生命科学行业的应用也支持容器化部署，从而降低业务部署的复杂性。阿里云E-HPC 发布了高性能容器应用eStack，支持通过容器镜像部署集群计算任务。在支持E-HPC 原有能力（如弹性伸缩、性能监控等）的基础上，高性能容器应用eStack 可为生命科学类应用提供更加高效和便捷的解决方案。

生信行业应用大内存解决方案

在基因测序数据分析过程中，每个细胞的表达量数据高达数十万条读取 （reads），这种海量级的数据分析对内存容量提出了更高的要求。针对大内存容量需求的场景，阿里云与合作伙伴MemVerge联合推出了生信行业应用大内存解决方案。

生信行业应用高I/O解决方案

在生物信息领域里有一个分支是组织学，该分支主要将基因检测设备检测出来的基因数据文件进行比对、分析、拼接和筛选等工作，在由此建立起来的测序与分析pipeline过程中，基因研究产生的数据快速增长且需长期保存，这就要求存储系统具有海量容量及高扩展性。另外，基因研究应用软件种类众多，部分计算任务对I/O吞吐要求很高，需要在分析处理阶段保证并行执行应用程序的读写性能，这就需要存储系统能提供高吞吐能力，支持进行连续地并行读写。针对基因组织学应用对存储容量和性能的较高要求，阿里云与合作伙伴联科集团联合推出生信行业应用高I/O解决方案。