概览
借助该SDK，Apache Hadoop的计算分析应用（如MapReduce、Hive、Spark等）可以使用 文件存储 HDFS 版 作为defaultFS，从而获得 文件存储 HDFS 版 带来的超越原始HDFS的功能和性能优势。更多信息，请参见 安装文件系统SDK、SDK示例。
文件存储HDFS版
借助该SDK，Apache Hadoop的计算分析应用（如MapReduce、Hive、Spark、Flink等）可以无需修改代码和编译，直接使用文件存储HDFS版作为defaultFS，从而获得超越原始HDFS的功能和性能优势。如果您更习惯使用图形化的Web应用程序，可以使用...
非EMR集群接入OSS-HDFS服务快速入门
JindoSDK为Apache Hadoop的计算分析应用（例如MapReduce、Hive、Spark、Flink等）提供了访问HDFS服务的能力。本文介绍如何通过在ECS实例中部署JindoSDK，然后完成OSS-HDFS服务快速入门相关操作。前提条件 已创建ECS实例。具体步骤，请参见 ...
性能优化最佳实践
避免使用小文件 处理小文件并非Hadoop的设计目标，Hadoop分析引擎处理大量小文件的速度远远小于处理同等数据量的大文件的速度。每一个小文件都会占用一个task，而task启动将耗费大量时间，造成作业的大部分时间都耗费在启动task和释放task...
利用实体批量投递运行任务
对于dnaseq应用分析的必须参数，通过实体表达式和固定值来填充，确保满足运行条件。同时可以直接在输出中定义新的表格列，来保存运行任务完成后的分析结果。提交后即可获得为指定应用设计好的运行模板。批量投递10个样本的分析运行任务 ...
基于Hadoop集群支持Delta Lake或Hudi存储机制
步骤三：基于MaxCompute实时分析Hadoop集群数据 基于已创建的MaxCompute项目以及Hadoop集群表数据，创建External Project，用于Hadoop集群，并映射至已创建的MaxCompute项目。后续可通过映射的MaxCompute项目对External Project进行数据...
应用监控概述
JVM监控 内存快照 主机监控 服务与接口监控 用于监控应用下的接口调用详情，包括SQL分析、NoSQL调用分析、异常分析、错误分析、链路上下游和接口快照。服务和接口监控 应用诊断-实时诊断 适用于在短时间内密切监控应用性能和定位问题原因的...
产品系列
数据库调用：概览、SQL调用分析、调用链查询、拓扑图、异常分析、调用来源 应用诊断-异常分析 应用诊断-Arthas诊断 外部调用：概览、调用来源 NoSQL调用 MQ监控 应用诊断-实时诊断 应用诊断-线程分析 应用诊断-日志分析 查看应用环境：IP、...
工作空间
应用配置：管理用户基因分析应用，包括安装公共应用，创建、编辑个人应用。提供分析应用的模板功能，提供控制台内批量启动大规模样本分析的能力。分析任务：管理用户的基因分析任务，包括创建、查询、终止、恢复运行任务。提供投递功能，...
创建编辑应用
创建应用时，如果应用名称已经存在，即为创建/编辑该应用的新版本 工作空间中用户创建的应用版本号由平台自动管理，即从0开始，整数递增，迭代版本数目限制见 单应用可修改的版本数 在工作空间的应用列表中，我们可以编辑指定应用：来源于...
计费概述
计费示例 以用户在基因分析平台中，选择使用的 sentieon/dnaseq 应用，分析一个30x的全基因测序样本为例。平台收费明细如下：30x WGS测序样本，~90G fastq文件 使用 sentieon/danseq:201911-v1.1 基因分析应用，5小时完成费用总计 应用步骤...
日志分析（日志服务SLS）
当应用出现业务异常问题时，您可以分析业务日志，精准定位业务异常。日志分析功能支持分析日志服务SLS或直接采集的日志，本文介绍如何开通日志分析功能并分析日志服务SLS的日志。前提条件 已接入应用监控。具体操作，请参见 应用监控接入...
应用强弱依赖治理
应用强弱依赖治理提供应用层面的强弱依赖关系分析。用户可以选择单个治理应用，查看其依赖分析，并根据依赖验证结果操作演练，完成依赖治理，治理周期为30天。本文介绍应用强弱依赖治理的操作步骤。前提条件 需要安装探针才能识别到应用，...
应用列表
质量分析 应用列表的最后一项展示了该应用的Trace数据质量，您可以单击分数打开质量分析结果页面，根据质量分析的各项评分优化Trace数据质量，高质量的Trace数据能够帮助您提升Trace数据的价值以及问题诊断的效率。说明 出于应用列表页的...
基本概念
基因分析平台基础概念 基因分析平台的相关基础概念如下表所示：概念 说明 地域/region 基因分析平台中的数据文件、表格、应用以及运行等资源，都属于阿里云公共云上的某个地域，如 华北2（北京）。在用户进行基因计算时，这些资源也必须...
Sentieon
关于Sentioen Sentieon® 成立于2014年，拥有算法、软件和系统调优的专业团队，开发了众多高度优化生物信息分析应用，获得precisionFDA组织的挑战赛的冠军，并在大学、医院等知名机构中得到广泛应用。软件功能 基因分析平台集成了...
日志分析（直接采集）
当应用出现业务异常问题时，您可以通过分析业务日志，精准定位业务异常。日志分析功能支持分析日志服务SLS或直接采集的日志，本文介绍如何开通日志分析功能并分析直接采集的日志。前提条件 ARMS Agent版本为v2.7.1.4或以上。登录 ARMS控制...
K8s集群应用部署失败的原因分析
当您在EDAS的K8s集群中创建、部署或扩容应用后，可以跳转到应用详情页面查看变更状态，同时还可以在变更记录中查看和分析应用部署失败的常见原因。查看部署失败的执行结果 在执行完应用部署操作后，返回 应用总览 页面。在 应用总览 上方，...
2024年
联系人 2024年02月 模块 功能名称 变更类型 功能描述 相关文档 应用监控 调用链分析 新增 调用链分析的错/慢Trace分析功能，能够自动分析错/慢链路关键性特征并给出分析结论，帮助您进行异常诊断或者架构优化。错/慢Trace分析 应用监控 ...
通过火焰图定位性能瓶颈
实践分析 ARMS持续剖析功能通过火焰图可视化技术呈现应用的性能剖析数据，当线上应用出现CPU、内存资源使用率高或大量慢调用问题时，可以通过该功能生成的火焰图对其进行根因定位，从而协助开发者优化程序、降低延迟、增加吞吐、节约成本。...
日志分析（旧版）
当应用出现业务异常问题时，您可以通过分析业务日志，精准定位业务异常。本文介绍如何开通并使用ARMS日志分析功能。前提条件 ARMS Agent版本为v2.7.1.3或以上。登录 ARMS控制台，在 应用监控>Agent列表 页面的 Java版本发布说明 页签获取2....
什么是基因分析平台？
结合阿里云海量的存储计算资源、连通测序上下游的用户网络、以及数据和应用的生态合作伙伴，基因分析平台广泛用于基因组学数据从样本到报告的分析全过程，可以作为不同应用系统计算底座，全方位满足基因组学科学研究和临床应用的需要。...
入门概述
本文介绍开始使用基因分析平台前的准备工作，产品...用户可以使用应用仓库中提供的公共应用，在系统创建的默认空间内，使用应用配套的测试文件，跟随 控制台使用教程，2分钟内上手完成一个基因分析任务。更多平台使用方法，请查看 用户指南。
Top N应用监控
应用托管到 Serverless 应用引擎 SAE（Serverless App Engine）后，SAE 会采集并分析应用数据，包括异常实例数、发布单失败率等，并在概览页显示每个指标Top N的应用列表，方便您实时、直观地了解应用的状态。操作步骤 登录 SAE控制台。在 ...
常见问题
问：是否有用户需要的分析应用能够直接使用？答：基因分析平台通过应用仓库为用户提供开箱即用的公共应用，用户只需安装到工作空间即可使用。这部分内容由我们的合作伙伴以及开源社区提供，目标是覆盖行业内主流的分析应用场景。目前主要...
使用内存热点诊断堆内存使用高的问题
说明 语言 列显示 图标的应用为接入应用监控的应用，显示-图标的应用为接入 可观测链路 OpenTelemetry 版 的应用。在左侧导航栏中单击 应用设置，然后单击 自定义配置 页签。在 持续剖析 区域开启 总开关，然后开启 内存热点 开关，配置...
使用代码热点诊断慢调用链的问题
说明 语言 列显示 图标的应用为接入应用监控的应用，显示-图标的应用为接入 可观测链路 OpenTelemetry 版 的应用。在左侧导航栏中单击 应用设置，然后单击 自定义配置 页签。在 持续剖析 区域开启 总开关，然后开启 代码热点 开关，配置...
使用CPU热点诊断CPU消耗高的问题
说明 语言 列显示 图标的应用为接入应用监控的应用，显示-图标的应用为接入 可观测链路 OpenTelemetry 版 的应用。在左侧导航栏中单击 应用设置，然后单击 自定义配置 页签。在 持续剖析 区域开启 总开关，然后开启 CPU热点 开关，配置需要...
产品优势
阿里云基因分析平台是由阿里云完全托管，专门服务于基因测序行业的公有云产品。与传统的HPC集相比，无需任何前期投入，完全享有云计算敏捷灵活、按需付费和超大规模的优势。并且产品围绕基因行业的数据和应用特点，开发了众多专业能力，...
计费概述
日志 SAE 可以使用SLS日志服务进行聚合和分析应用文件日志。关于SLS日志服务计费说明，请参见 SLS计费说明。存储 SAE 通过支持NAS存储来实现持久化数据。关于NAS存储服务计费说明，请参见 NAS计费说明。账户扣款顺序 账户扣费的先后顺序...
Hadoop使用JindoSDK访问OSS-HDFS服务
什么是OSS-HDFS服务 通过OSS-HDFS服务，无需对现有的Hadoop、Spark大数据分析应用做任何修改。通过简单的配置即可像在原生HDFS中那样管理和访问数据，同时获得OSS无限容量、弹性扩展、更高的安全性、可靠性和可用性支撑。作为云原生数据湖...
什么是OSS-HDFS服务
功能优势 通过OSS-HDFS服务，无需对现有的Hadoop、Spark大数据分析应用做任何修改。通过简单的配置即可像在原生HDFS中那样管理和访问数据，同时获得OSS无限容量、弹性扩展、更高的安全性、可靠性和可用性支撑。作为云原生数据湖基础，OSS-...
使用限制
应用诊断分析平台只提供分析诊断服务，不提供永久文件存储功能，会定期(7+天)清除您的文件，重要转储文件请务必提前使用OSS或其他方式存储 应用诊断分析平台免费提供50GB临时可用空间供您分析 应阿里云安全监管要求，为了最大程度保护用户...
分析视图
在分析时，目前暂不支持「session分析」外，其他功能的使用和应用分析功能一致，可直接进行分析使用。在分析时，可点击左上角的切换小站视图。2.多应用视图操作说明 1）创建多应用视图 进入「行为分析」-「分析首页」-「分析视图」点击分析...
联系我们
欢迎您加入应用诊断分析平台 ATP 客户支持钉钉群44948838，竭诚为您服务。
异常分析
EDAS提供了应用异常分析功能，包括异常数量统计、每类异常次数统计以及异常发生的端口等。本文介绍异常分析功能的使用方法。功能入口 登录 EDAS控制台。在左侧导航栏，单击 应用管理>应用列表，在顶部菜单栏选择地域并在页面上方选择微服务...
准备工作
本文简单介绍分析前的准备工作 第一步：生成数据源 应用诊断分析平台（ATP）只提供 诊断分析 能力，需要您准备数据源以供分析。1.什么是数据源？取决于您想分析的应用问题，数据源有所不同。Q：发现GC频率过快？GC回收效率低下？应用出现...
API概览
本产品（应用诊断分析平台/2022-06-06）的OpenAPI采用 ROA 签名风格，签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK，开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求...
使用平台公共应用
本文介绍如何使用平台公共应用进行基因数据分析。基因分析平台的 应用仓库 提供了不同研究领域和分类的公共应用，这些都是权威的、经过验证的行业最佳实践，并且提供了常见的运行参数，真正的帮助用户实现开箱即用的基因数据分析。浏览公共...
ATP无权限报错
1.阿里云权限控制错误 如果用户遇到如下报错：没有权限，请联系主账号，在访问控制RAM中授予相应权限 说明用户没有访问应用诊断分析平台ATP的权限，需要联系主账号前往 访问控制RAM 添加 AliyunGraceFullAccess 权限。具体操作如下：进入 ...
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