基因分析应用

以遗传病的数据分析举例,需要进行数据质控、序列比对、变异检测和变异注释等多个步骤。图1:基因数据分析流程(来源/《中华医学遗传学杂志》)我们以工作流(Pipeline or Workflow)来指代这些分析脚本。简单的来说,它可以是一段由用户...

软件概述

无 HMMER 3.2.1 基于隐马尔可夫模型,用于生物序列比对分析的软件。无 LAMMPS-CPU-INTELMPI 12Dec18 分子动力学模拟软件,多节点并行版本。Intel-MPI 2018 LAMMPS-GPU-OpenMPI 12Dec18 分子动力学模拟软件,多节点GPU加速版本。OpenMPI 3.0...

使用BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序

背景信息 生命科学领域内基因测序技术的飞速发展,人类发现的基因序列以指数级增长,对于如此数量庞大的基因进行同源性搜寻、比对、变异检查等,往往伴随着巨大的数据处理和并行计算。高性能计算可以提供强大的算力支持,使用多种调度器...

合并

在TSDB For InfluxDB®中,查询自动将序列合并。示例 数据库 NOAA_water_database 中的measurement的 h2o_feet 是两个序列的一部分。第一个序列由measurement h2o_feet 和tag location=coyote_creek 组成。第二个序列由measurement h2o_...

LIMIT及SLIMIT子句

LIMIT 和 SLIMIT 分别限制每个查询返回的数据点个数和序列个数。LIMIT子句 LIMIT返回指定measurement中的前 N 个数据点。语法 SELECT_clause[INTO_clause]FROM_clause[WHERE_clause][GROUP_BY_clause][ORDER_BY_clause]LIMIT语法描述 N ...

产品概述

时间序列数据库(Time Series Database,简称 TSDB)是一种高性能、低成本、稳定可靠的在线时间序列数据库服务,提供高效读写、高压缩比存储、时序数据插值及聚合计算等服务,广泛应用于物联网(IoT)设备监控系统、企业能源管理系统(EMS)、...

名词解释

背景信息 时间序列数据库 TSDB:英文全称为 Time Series Database,提供高效存取时序数据和统计分析功能的数据管理系统。时序数据(Time Series Data):基于稳定频率持续产生的一系列指标监测数据。例如,监测某城市的空气质量时,每秒...

产品优势

本文介绍时间序列数据库产品的优势。性能卓越 具有高效的读写能力,相较于开源的 OpenTSDB 和 InfluxDB,读写效率提升了数倍。支持横向扩展,性能可达到百万级别读和千万级别写入的数据点处理能力。存储成本低 基于高效压缩算法有效压缩...

OFFSET及SOFFSET子句

OFFSET 和 SOFFSET 分别标记数据点和序列返回的位置。OFFSET子句 OFFSET表示从查询结果中的第 N 个数据点开始返回。语法 SELECT_clause[INTO_clause]FROM_clause[WHERE_clause][GROUP_BY_clause][ORDER_BY_clause]LIMIT_clause OFFSET...

功能介绍

TSDB for Prometheus是阿里云时间序列数据库TSDB为Prometheus提供的一种高性能,低成本,稳定可靠的在线远端存储服务,提供高效读写,高压缩比存储。TSDB for Prometheus可无缝被Prometheus集成,在协议上原生支持Prometheus远端存储对接至...

TSDB开源生态概述

时间序列数据库TSDB以其强大的功能和兼容性,对于当前的一些开源解决方案实现了较好的适配。以下是TSDB与一些开源组件或开源项目对接的方法。Grafana如何对接TSDB Quick BI如何接入TSDB

HTTP API 概览

几乎所有 TSDB 的特性都可以通过 API 来访问,比如查询时间序列数据、管理元数据和存储数据点。TSDB 的 HTTP API 本质上是 RESTful 的,同时也提供了替代访问策略,因为不是所有 client 都可以遵循严格的 REST 协议。默认数据交换是通过 ...

专业术语

相反,当您向序列中写入一个新的数据点,并且该数据点的时间戳跟序列中某个数据点的时间戳相同,那么在该时间戳下的数据点的field set会变为旧field set和新field set的并集,以后访问这个数据点时,返回的都是修改后新的field set。...

版本说明

本文介绍时间序列数据库TSDB的Java SDK已发布的版本信息。TSDB的SDK采用开源的形态进行迭代开发,其代码托管在 Github。如果在使用过程中发现问题,推荐直接在Github上创建 Issue 进行反馈。我们也期待广大开发者为我们的SDK添砖加瓦。SDK...

ExploreHiTSDBInstanceData

描述 获取实例内的时间序列数据 请求参数 名称 类型 是否必需 描述 RegionId String 是 实例所在 Region ID InstanceId String 是 实例 ID ReverseIp String 是 实例反向 VPC IP ReversePort Integer 是 实例反向 VPC Port Metric String ...

Quick BI如何接入TSDB

前提条件 已创建阿里云时间序列数据库实例。背景信息 为避免因数据源白名单限制导致数据对接访问失败,您需将Quick BI不同网络环境下的IP地址段添加至数据源的白名单中,更多对接配置详情请参见 设置网络白名单。操作步骤 验证数据源连接并...

管控类API概览

ExploreHiTSDBInstanceData 获取实例内的时间序列数据。ExploreHiTSDBInstanceDeletionJobList 获取删除任务记录列表,接口内根据JobType不同分别标识为数据删除任务或时间线删除任务。UpdateHiTSDBInstanceDataTtl 更新数据过期时间。

InfluxDB®️介绍

主要特点 InfluxDB®是您处理时序数据的一个绝佳选择,目前有以下特点:专为时间序列数据量身打造的高性能数据存储。TSM引擎提供数据高速读写和压缩等功能。简单高效的HTTP API写入和查询接口。针对时序数据,量身打造类似SQL的查询语言,...

实践教程概览

在进行基因测序时,您可以使用BWA构建索引及比对记录,再使用Samtools对比对记录进行排序,然后使用GATK去除重复序列、重新校正碱基质量值、变异检查。使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算 OpenFOAM是对连续介质力学问题进行数值计算的...

物联网设备数据上云存储

如何使用规则引擎转发数据到 TSDB 您可以通过在阿里云物联网平台的控制台上配置规则引擎将物联网平台中的数据转发到时间序列数据库(TSDB)的实例中。具体详情请参见 数据转发到实例内的时序数据存储。注意:目前发布的地域有“华东2”只...

管理序列

在 OceanBase 开发者中心(OceanBase Developer Center,ODC)单击连接名进入一个 Oracle 模式的连接后,在左导航栏中单击 序列 标签可以查看序列列表。您可以在序列列表中右键目标对象以进行一些 管理操作。或者,在序列列表中双击目标...

CREATE SEQUENCE

CREATE SEQUENCE 用于创建一个新的序列数发生器。简介 CREATE SEQUENCE 创建一个新的序列数发生器。这涉及到用名称 name 创建并且初始化一个新的特殊的单行表。该发生器将由发出该命令的用户所拥有。如果给出一个模式名称,则该序列将被...

序列操作函数

本节描述对 sequence objects 进行操作的函数,也称为序列生成器或序列序列对象是使用CREATE SEQUENCE创建的特殊单行表。序列对象通常用于为表中的行生成惟一标识符。在序列函数表中列出的序列函数,提供了简单的、多用户安全方法,用于...

关键概念

以上示例数据中的共有4个序列:Arbitrary series number Retention policy Measurement Tag set series 1 autogen census location=1,scientist=langstroth series 2 autogen census location=2,scientist=langstroth series 3 autogen ...

CREATE SEQUENCE

定义新序列生成器。语法 CREATE SEQUENCE name[INCREMENT BY increment][{ NOMINVALUE|MINVALUE minvalue }][{ NOMAXVALUE|MAXVALUE maxvalue }][START WITH start][CACHE cache|NOCACHE][CYCLE]说明 CREATE SEQUENCE 可创建新的序列号生成...

新建序列

在 OceanBase 开发者中心(OceanBase Developer Center,ODC)单击连接名进入一个 Oracle 模式的连接后,在左导航栏中单击 序列 标签可以查看序列列表。在序列列表的右上角,单击+创建序列,或是在 ODC 上方导航栏中单击 新建>序列 以创建...

ALTER SEQUENCE

ALTER SEQUENCE 更改一个现有序列发生器的参数。简介 ALTER SEQUENCE 更改一个现有序列发生器的参数。任何没有在 ALTER SEQUENCE 命令中明确设置的参数保持它们之前的设置。要使用 ALTER SEQUENCE,你必须拥有该序列。要更改一个序列的模式...

创建与使用序列

定义一个新的序列生成器。语法 CREATE SEQUENCE name[INCREMENT BY increment][{ NOMINVALUE|MINVALUE minvalue }][{ NOMAXVALUE|MAXVALUE maxvalue }][START WITH start][CACHE cache|NOCACHE][CYCLE]参数 参数名称 描述 name 创建的序列...

金融级人脸比对方案

金融级人脸比对方案 通过人脸识别技术,可以对传入的两张人脸图片进行比对验证,返回人脸对比结果和相似度分值。本文介绍通过 纯服务端(API)接入 金融级人脸对比的方案。计费方式 按照成功调用次数计费。有关计费的详细信息,请参见 计费...

序列帧动画

序列帧动画支持独立的样式和数据配置,包括序列帧动画的动画缩放倍数、高度偏移和序列帧合成图片等,本文介绍序列帧动画配置项的含义。在场景编辑器左侧图层列表中,单击 序列帧动画 图层,进入配置面板配置 序列帧动画 图层的样式和数据。...

序列帧动画

序列帧动画支持独立的样式和数据配置,包括序列帧动画的动画缩放倍数、高度偏移和序列帧合成图片等,本文介绍序列帧动画配置项的含义。在场景编辑器左侧图层列表中,单击 序列帧动画 图层,进入配置面板配置 序列帧动画 图层的样式和数据。...

开发指南

PromQL参考 PromQL是Prometheus提供的一种功能查询语言,允许用户实时选择和汇总时间序列数据。如要了解更多有关PromQL的内容,请参考Prometheus官方提供的 PromQL文档。TSDB for Prometheus内置实现的remote storage adapter接口,极大...

人脸比对API

人脸比对方案利用基于深度学习的人脸识别技术,比对两张照片是否是同一个人。应用场景 人脸比对方案可以帮助您实现以下业务场景:当您已留底人脸照片,需要验证当前采集的人像是否与留底照片为同一人的情况。当您已通过二代身份证阅读器读...

人脸比对

本文介绍如何使用Go SDK人脸比对接口,对指定的人脸图片进行比对,检测不同人脸图片的相似度。功能描述 人脸比对支持同步检测和异步检测两种方式。同步检测实时返回检测结果。关于参数的详细信息,请参见 同步检测。异步检测需要您轮询结果...

pg_sequences

pg_sequences 视图提供对数据库中每个序列的信息的访问。简介 pg_sequences 视图提供对数据库中每个序列的信息的访问。列名称 列类型 描述 schemaname name 包含序列的模式名。sequencename name 序列的名称。sequenceowner name 序列的...

序列帧动画

序列帧动画支持独立的样式和数据配置,包括序列帧动画的动画缩放倍数、高度偏移和序列帧合成图片等,本文介绍序列帧动画配置项的含义。在场景编辑器左侧图层列表中,单击 序列帧动画 图层,进入配置面板配置 序列帧动画 图层的样式和数据。...

pg_sequences

pg_sequences 视图提供对数据库中每个序列的信息的访问。简介 pg_sequences 视图包含以下列信息:列名称 类型 描述 schemaname name 序列的模式名。sequencename name 序列的名称。sequenceowner name 序列的拥有者的名称。data_type ...

分布式序列问题

分布式序列是否全局唯一 单库单表的分布式序列可以保证生成的序列 ID 全局唯一。分库分表的分布式序列仅保证单个分片的序列 ID 唯一,如果需要确保分库分表的分布式序列全局唯一,可以在序列 ID 中拼接分库分表位,以此保证全局唯一。分布...

常见问题

当写入导致数据库中序列的数量超过每个数据库允许的最大序列数量时,错误 max series per database exceeded 就会发生。每个数据库允许的最大序列数量由购买的实例规格所决定。内的信息展示了那些超出 max-series-per-database 限制的序列...

ALTER SEQUENCE

更改序列生成器的定义。语法 ALTER SEQUENCE name[INCREMENT BY increment][MINVALUE minvalue][MAXVALUE maxvalue][CACHE cache|NOCACHE][CYCLE]说明 ALTER SEQUENCE 可更改现有序列生成器的参数。ALTER SEQUENCE 命令中未特别设置的任何...
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