入门概述
本文介绍E-HPC的使用流程，帮助您快速上手使用弹性高性能计算。下文以创建集群，在集群中安装GROMACS软件并运行水分子算例进行高性能计算为例，介绍弹性高性能计算的使用流程，帮助您快速上手使用弹性高性能计算。使用流程如下图所示。创建...
基本概念
本文汇总使用弹性高性能计算E-HPC过程中涉及的基本概念，方便您查询和了解相关概念。使用弹性高性能计算涉及的相关概念如下表所示。概念 说明 集群 集群指运行高性能计算的节点集合，可以提供单节点不能提供的强大计算能力，拥有高性能、...
服务条款
请参见 弹性高性能计算（E-HPC）服务协议。
服务等级协议
请参见 弹性高性能计算服务等级协议。
实践教程概览
集群性能测试 实践教程 主要内容 使用HPL测试E-HPC浮点性能 HPL（The High-Performance Linpack Benchmark）是测试高性能计算集群系统浮点性能的基准。HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高...
管理用户
创建用户 打开弹性高性能计算控制台的 用户 页面。登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>用户。在 用户 页面，从 集群 列表中选择目标集群，然后单击 新增用户。在 新增用户 页面，...
查看集群性能
查看性能大盘 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业 与性能 管理>E-HPC优化器。在 性能大盘 页面，找到目标集群，查看集群的基本信息和节点热力图。如上图所示，热力图中每个方格表示一个...
安装与卸载软件
使用E-HPC集群进行高性能计算时，需要根据业务需求安装相关业务软件。本文介绍如何安装和卸载软件。安装软件 您可以通过控制台直接安装E-HPC提供的常用软件，也可以在集群中手动安装其他软件。通过控制台安装 登录 弹性高性能计算控制台。...
停止和启动集群
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，选择需要停止的集群，单击 更多>集群停机。在弹出的 集群停机 对话框，单击 确定。集群将进入 停止中 状态，最终变为 停止 状态。...
使用VNC远程可视化
弹性高性能计算提供VNC远程可视化功能，您可以通过控制台Web方式访问远程可视化图形界面。本文介绍如何连接可视化服务和停止可视化服务。前提条件 已安装VNC服务。开启方式如下：创建新的集群时，您可以在 软件配置 页开启VNC功能，系统将...
停止作业
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业与性能管理>作业。在 作业 页面，在 集群 列表中选择作业所在集群。单击 作业列表 页签，在作业状态栏选择 未完成。单击要停止的作业操作列...
通过RAM用户分权管理集群
修改RAM用户的控制台权限 默认情况下，RAM用户具有弹性高性能计算控制台的所有页面的访问权限，控制台左侧导航栏将显示全部功能菜单项。修改RAM用户的控制台权限功能可以控制RAM用户访问弹性高性能计算控制台时，左侧导航栏的菜单项显示。...
创建用户
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>用户。在 用户 页面，在集群列表中选择目标集群，单击 新增用户。在 新增用户 页面，根据提示填写用户信息。参数 示例 描述 用户名 gmx...
释放集群
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，选择需要释放的集群，单击 更多>释放。在弹出的 删除集群 对话框，单击 确认。集群将进入 释放中 状态，释放完成后集群列表...
测试SCC集群性能
超级计算集群SCC具有无虚拟化损耗、高带宽低延迟网络的优点，可以保证高性能计算和人工智能、机器学习等应用的高度并行需求。本文为您介绍如何创建SCC集群，并测试SCC集群的相关性能。背景信息 超级计算集群SCC（Super Computing Cluster）...
创建以CPFS为共享存储的E-HPC集群
背景信息 CPFS（Cloud Paralleled File System）是一种高性能并行文件存储系统，专为AI训练和E-HPC等高性能计算场景打造，最大支持数十GB/s吞吐能力。CPFS的数据存储在集群中的多个数据节点，并可由多个客户端同时访问，从而能够为大型E-...
自动伸缩最佳实践
本文以使用LAMMPS软件进行高性能计算介绍如何配置自动伸缩策略。背景信息 当您需要每天不定时提交作业，使用E-HPC集群几个小时进行大规模计算，然后释放节点，您可以针对不同的作业类型，配置不同的伸缩策略。配置伸缩策略后，系统可以根据...
运行HPL、iPerf和FIO以测试集群性能
HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高性能计算集群的浮点计算能力。iPerf：一个网络性能测试工具，支持设置协议、时间等相关参数，可以报告带宽、数据包丢失等。FIO：一个开源的I/O压力测试...
查看作业结果
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业与性能管理>作业。单击目标作业列表右侧 详情，可以查看作业详细信息。查看作业性能指标。在左侧导航栏，选择 作业 与性能 管理>E-HPC优化器...
管理队列
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>节点与队列。在 集群 列表中选择目标集群。在 节点类型 列表中选择计算节点。按照需要进行以下操作。创建新的队列 单击打开 队列 下拉列表，然后...
实例
不论当前实例规格，使用时序模型时，时间线数据的按量读写吞吐量均按照容量型读写计费，时间线元数据的按量读写吞吐量均按照高性能读写计费，且时间线元数据的数据存储均按照高性能存储计费。更多信息，请参见 时序模型计量计费。类型/对比...
服务包
服务包用于抵扣E-HPC服务费，如果您的...在 弹性高性能计算控制台 的 服务包 页面，找到目标服务包，单击 升级。在 变配 页面，根据需要选择要升级的规格或者购买时长。阅读并选中服务协议，然后单击 去支付。按页面提示完成后续支付操作。
更新ehpcutil版本
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 详情。在 集群详情 页面底部的 ehpcutil版本信息 区域，根据需要进行升级或者回退操作。如果当前...
查看E-HPC操作日志
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 运维与监控>操作日志。在 集群 列表中选择目标集群。根据需要设置查询条件，单击 图标。查询条件说明如下：查询条件 说明 时间范围 快速选择：可...
管理作业模板
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业 与性能 管理>作业。在 作业 页面，选择待创建作业模板的集群。单击页面左侧的 提交作业 页签。在 提交作业 区域，完成作业参数配置，单击 图标将当前...
监控作业
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业与性能管理>作业。在 作业 页面，选择目标集群，单击 作业监控 页签。设置筛选条件。支持设置的筛选条件如下：时间段：过滤某一时间段内的...
使用HPL测试集群浮点性能
HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高性能计算集群的浮点计算能力。浮点计算峰值是指计算机每秒可以完成的浮点计算次数，包括理论浮点峰值和实测浮点峰值。理论浮点峰值是该计算机理论上每秒...
查看集群报表
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业与性能管理>报表。在顶部下拉列表中，选择目标集群。查看报表。查看集群节点数量。节点数量展示集群中节点数量的变化折线图，支持显示各队列...
登录集群
规则方向 授权策略 端口范围 优先级 授权对象 入方向 允许 SSH（22）1 0.0.0.0/0 通过控制台登录 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到要登录的集群，单击 远程连接。...
使用AutoDock Vina软件进行药物筛选
本文以AutoDock Vina软件为例，介绍如何在E-HPC上进行高性能计算实现虚拟药物筛选。背景信息 分子对接（Molecular docking）是虚拟药物筛选中的关键环节。AutoDock Vina作为一款开源的分子对接软件，具有速度快、算法准确等优点，特别适用...
使用IMB软件和MPI通信库测试集群通信性能
MPI_DEBUG 5-np 2-ppn 1-host compute000,compute001/opt/intel-mpi-benchmarks/2019/IMB-MPI1 pingpong>IMB-pingpong#请根据实际调整参数 脚本示例使用2个计算节点，每个节点为8 vCPU，使用一个MPI任务进行高性能计算。实际测试中请根据...
通过控制台提交作业
作业指提交到E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元，包括Shell脚本、可执行文件等，具体作业执行顺序根据您设置的队列以及调度器决定。E-HPC管理控制台提供了作业相关的提交作业、停止作业、查看作业状态等功能，本文介绍如何使用E-HPC...
使用GROMACS进行分子动力学模拟
通过控制台 在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 更多>VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作，请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中，选择 Application>System Tools>Terminal。运行/...
创建作业
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在 集群 页面，找到gromacs-test集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入gmx.test的用户名、密码和节点端口，单击 ssh连接。下载并解压算例。说明 本算例为模拟...
通过钉钉机器人发送事件通知
E-HPC支持的事件信息请参见 弹性高性能计算E-HPC事件。在 配置事件目标 页面，参考参数说明完成配置，单击 创建。首次操作时，需完成服务授权，允许阿里云事件总线访问审计日志。参数说明如下：服务类型：选择 钉钉。地址：填入钉钉机器人...
账单查询
查询时，筛选产品为 弹性高性能计算 可以查看E-HPC服务费的账单，您也可以筛选产品查询集群内资源的账单，例如如果想要查看集群节点资源费用，可以筛选产品为 云服务器 ECS。查询示例如下：说明 单击账单右上角的 定制列，可以选择您希望...
使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入集群用户名、登录密码和端口，单击 ssh连接。步骤二：运行算例 ...
提交作业
作业是E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元，包括Shell脚本、可执行文件等。本文介绍如何使用E-HPC客户端提交作业。准备工作 提交作业前，您需要准备好作业文件，并上传到E-HPC集群中。E-HPC客户端支持以下两种方式上传作业文件：通过...
手动扩容集群
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到需要扩容的集群，单击 扩容。在 集群扩容 面板，完成节点配置。扩容时，支持添加新建节点、已有节点或线下节点，请根据需要选择...
E-HPC普通服务角色
通过AliyunECSInstanceForEHPCRole，ECS实例可以获得云服务器ECS、弹性高性能计算E-HPC的访问权限。RAM用户使用普通服务角色需要的权限 如果使用RAM用户创建或删除普通服务角色，必须使用阿里云账号为该RAM用户授权。方式一：授予...
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