使用Fluid实现数据加速访问

JindoRuntime是基于C++实现的支撑Dataset数据管理和缓存的执行引擎,支持OSS对象存储。Fluid通过管理和调度JindoRuntime实现数据集的可见性、弹性伸缩和数据迁移。本文介绍如何在ACK集群Pro使用ACS算力场景下使用Fluid实现数据加速访问。

前提条件

操作步骤

步骤一:准备OSS Bucket的数据

  1. 执行以下命令,将测试数据下载到ECS实例中。

    wget https://archive.apache.org/dist/spark/spark-3.0.1/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz
  2. 将下载的测试数据上传到阿里云OSS对应的Bucket中。

    重要

    上传到OSS的步骤以Alibaba Cloud Linux 3.2104 LTS 64位的ECS实例为例。其他操作系统的具体操作,请参见命令行工具ossutil命令参考命令行工具ossutil 1.0

    1. 安装ossutil

    2. 输入以下命令,创建名称为examplebucketBucket存储空间。

      说明

      如果执行命令后返回ErrorCode=BucketAlreadyExists,表示Bucket名称已经存在。由于Bucket名称在OSS范围内必须全局唯一,请按实际情况修改examplebucket

      ossutil64 mb oss://examplebucket

      预期输出:

      0.668238(s) elapsed

      以上输出结果表明已成功创建examplebucket

    3. 将下载的测试数据上传到新建的examplebucket中。

      ossutil64 cp spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz oss://examplebucket
    4. (可选)设置Bucket和数据的访问权限。具体内容,请参见权限控制

步骤二:创建DatasetJindoRuntime

  1. 在创建Dataset之前,在ECS实例中的根目录中创建一个mySecret.yaml文件。

    apiVersion: v1
    kind: Secret
    metadata:
      name: mysecret
    stringData:
      fs.oss.accessKeyId: xxx
      fs.oss.accessKeySecret: xxx

    其中,fs.oss.accessKeyIdfs.oss.accessKeySecret步骤一:准备OSS Bucket的数据中用来访问OSSAccessKey IDAccessKey Secret

  2. 执行以下命令,生成Secret。Kubernetes会对已创建的Secret使用加密编码,避免将其明文暴露。

    kubectl create -f mySecret.yaml
  3. 使用以下YAML文件样例创建一个名为resource.yaml的文件,里面包含两部分:

    • 创建一个Dataset,描述远端存储数据集和UFS的信息。

    • 创建一个JindoRuntime,启动一个JindoFS的集群来提供缓存服务。

    说明

    通过kubectl get pods --field-selector=status.phase=Running -n fluid-system命令可以检查ack-fluid组件中的dataset-controllerjindoruntime-controller是否正常运行。

    apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1
    kind: Dataset
    metadata:
      name: hadoop
    spec:
      mounts:
        - mountPoint: oss://<oss_bucket>       # 请按实际情况修改<oss_bucket>
          options:
            fs.oss.endpoint: <oss_endpoint>    # 请按实际情况修改<oss_endpoint>
          name: hadoop
          path: "/"
          encryptOptions:
            - name: fs.oss.accessKeyId
              valueFrom:
                secretKeyRef:
                  name: mysecret
                  key: fs.oss.accessKeyId
            - name: fs.oss.accessKeySecret
              valueFrom:
                secretKeyRef:
                  name: mysecret
                  key: fs.oss.accessKeySecret
    ---
    apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1
    kind: JindoRuntime
    metadata:
      name: hadoop
    spec:
      replicas: 2
      tieredstore:
        levels:
          - mediumtype: MEM
            path: /dev/shm
            volumeType: emptyDir
            quota: 2Gi
            high: "0.99"
            low: "0.95"

    相关参数解释如下表所示:

    参数

    说明

    mountPoint

    oss://<oss_bucket>表示挂载UFS的路径,<oss_bucket>OSS Bucket的名称,路径中不需要包含endpoint信息,例如:oss://examplebucket

    fs.oss.endpoint

    OSS BucketEndpoint信息,公网或私网地址均支持,例如:oss-cn-beijing-internal.aliyuncs.com。更多信息,请参见OSS地域和访问域名

    replicas

    表示创建JindoFS集群的Worker数量。

    mediumtype

    表示缓存类型。在创建JindoRuntime模板样例时,JindoFS暂时只支持HDD/SSD/MEM中的一种缓存类型。

    path

    表示存储路径,暂时只支持单个路径。当选择MEM做缓存时,需指定一个本地路径来存储Log等文件。

    quota

    表示缓存最大容量,单位为Gi。

    high

    表示存储容量上限大小。

    low

    表示存储容量下限大小。

  4. 执行以下命令,创建JindoRuntimeDataset。

    kubectl create -f resource.yaml
  5. 执行以下命令,查看Dataset的部署情况。

    kubectl get dataset hadoop

    预期输出:

    NAME     UFS TOTAL SIZE   CACHED   CACHE CAPACITY   CACHED PERCENTAGE   PHASE   AGE
    hadoop   209.74MiB        0.00B    4.00GiB          0.0%                Bound   56s
  6. 执行以下命令,查看JindoRuntime的部署情况。

    kubectl get jindoruntime hadoop

    预期输出:

    NAME     MASTER PHASE   WORKER PHASE   FUSE PHASE   AGE
    hadoop   Ready          Ready          Ready        2m11s
  7. 执行以下命令,查看PVPVC的创建情况。

    kubectl get pv,pvc

    预期输出:

    NAME                              CAPACITY   ACCESS MODES   RECLAIM POLICY   STATUS   CLAIM            STORAGECLASS   VOLUMEATTRIBUTESCLASS   REASON   AGE
    persistentvolume/default-hadoop   100Pi      ROX            Retain           Bound    default/hadoop   fluid          <unset>                          2m5s
    
    NAME                           STATUS   VOLUME           CAPACITY   ACCESS MODES   STORAGECLASS   VOLUMEATTRIBUTESCLASS   AGE
    persistentvolumeclaim/hadoop   Bound    default-hadoop   100Pi      ROX            fluid          <unset>                 2m5s

从上述输出的查询信息,可以知道DatasetJindoRuntime已创建成功。

步骤三:创建应用容器体验加速效果

您可以通过创建应用容器来使用JindoFS加速服务,或者提交机器学习作业来体验相关功能。本文以创建一个应用容器多次访问同一数据,并通过比较访问时间来展示JindoRuntime的加速效果。

  1. 使用以下YAML文件样例,创建名为app.yaml 的文件。

    apiVersion: v1
    kind: Pod
    metadata:
      name: demo-app
      labels:
        # ACS的挂载需要使用到Fluid WebhookSidecar注入,所以需要配置如下label
        alibabacloud.com/fluid-sidecar-target: acs
        # 计算类型为performance性能型 
        alibabacloud.com/compute-class: performance
    spec:
      containers:
        - name: demo
          image: mirrors-ssl.aliyuncs.com/nginx:latest
          volumeMounts:
            - mountPath: /data
              name: hadoop
          resources:
            requests:
              cpu: 14
              memory: 56Gi
      volumes:
        - name: hadoop
          persistentVolumeClaim:
            claimName: hadoop
      nodeSelector:
        type: virtual-kubelet
      tolerations:
        - key: virtual-kubelet.io/provider
          operator: Equal
          value: alibabacloud
          effect: NoSchedule
  2. 执行以下命令,创建应用容器。

    kubectl create -f app.yaml
  3. 执行以下命令,查看文件大小。

    kubectl exec -it demo-app -c demo -- bash
    du -sh /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz

    预期输出:

    210M    /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz
  4. 执行如下命令,查看文件的拷贝时间。

    time cp /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz /dev/null

    预期输出:

    real    0m1.883s
    user    0m0.001s
    sys     0m0.041s

    上述输出信息显示本次文件拷贝时间消耗了1.883秒。由于是第一次拷贝该文件,此次操作并未使用JindoFS缓存加速能力。

  5. 退出demo-app,执行以下命令,查看此时Dataset的缓存情况。

    kubectl get dataset hadoop

    预期输出:

    NAME     UFS TOTAL SIZE   CACHED      CACHE CAPACITY   CACHED PERCENTAGE   PHASE   AGE
    hadoop   209.74MiB        209.74MiB   4.00GiB          100.0%              Bound   64m

    上述输出信息显示100.0%的数据都已经在JindoFS缓存。

  6. 执行以下命令,删除之前的应用容器,新建相同的应用容器。

    说明

    这样做的目的是为了避免其他因素(例如:Page Cache)对结果造成影响,如果节点已经存在本地缓存,拷贝操作会优先使用本地缓存。

    kubectl delete -f app.yaml && kubectl create -f app.yaml
  7. 执行如下命令,查看文件拷贝时间。

    kubectl exec -it demo-app -c demo -- bash
    time cp /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz /dev/null

    预期输出:

    real    0m0.203s
    user    0m0.000s
    sys     0m0.047s

    上述输出信息显示本次文件拷贝时间消耗了0.203秒,比第一次缩短了约9倍。由于此时文件已经被JindoFS缓存,第二次访问所需时间远小于第一次。

    重要

    本文中提供的拷贝时间数据仅为参考值,实际数据请以您的操作环境为准。