是否支持将ECS实例上的自建数据库迁移到其他阿里云账号下的RDS实例

支持，您需要将ECS上的自建数据库以公网IP（旧控制台为有公网IP的自建数据库）的方式接入DTS，来完成迁移任务配置，详情请参见迁移方案概览。