本文介绍基因分析平台的版本变更信息,包括发布时间、版本变更内容、核心功能特性等信息。
2024年10月
模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
应用仓库 | 全基因组选择 | damo/genomic-selection-dataset | 【新增】全基因组选择算法数据集构建 |
damo/genomic-selection-train | 【新增】全基因组选择算法模型训练 | ||
damo/genomic-selection-pred-self | 【新增】全基因组选择算法自交系表型预测 | ||
damo/genomic-selection-pred-f1 | 【新增】全基因组选择算法杂交F1代表型预测 |
2024年9月
模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
应用配置 | 创建应用(WDL) | runtime | 【新增】支持runtime中同时指定多个规格的机器,如type=gc6.small,gc5.medium,gc4.medium |
【新增】支持runtime中直接声明磁盘大小(此时默认使用nas_cap数据盘类型) | |||
【新增】runtime中支持cloud_essd、cloud_essd_pl1、nas_per、nas_cap四种数据盘类型 | |||
【新增】runtime中支持通过env指定挂载oss bucket(兼容挂载同账号和跨账号的oss bucket) | |||
【新增】runtime中支持设置sentieon license环境变量的方式使用sentieon | |||
运行选项设置 | 【新增】支持选择数据加载模式为挂载或下载(前端默认挂载) | ||
应用仓库 | 变异分析 | sentieon | 【更新】sentieon需要通过设置sentieon license环境变量的方式继续使用 |
序列比对 | damo/vardict | 【新增】CPU并行加速的vardict | |
damo/bwa-mem2 | 【新增】基于云优化的bwa-mem2 | ||
damo/bwa-mem2-index | 【新增】bwa-mem2索引构建 | ||
damo/blastn | 【新增】基于云优化的blastn | ||
damo/blastn-makedb | 【新增】blastn数据库构建 |
2024年8月
模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
应用仓库 | 序列比对 | damo/align-markdup-bqsr | 【新增】GPU版本序列比对排序去重bqsr |
变异识别 | damo/haplotype-calling | 【新增】GPU版本HaplotypecCaller | |
序列压缩 | damo/fqcompress | 【新增】高压缩比的fastq压缩 | |
damo/fqdecompress | 【新增】高压缩比的fastq解压 | ||
变异识别索引 | damo/dna-index | 【新增】GPU变异分析流程索引构建 |
2024年6月
模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
应用仓库 | 群体变异识别 | damo/dna-variant-calling | 【新增】GPU变异分析流程 |
damo/joint-calling | 【新增】CPU+GPU群体变异分析流程 |
2021年5月
发布时间 | 版本变更内容 | 核心功能特性 |
2021-05-28 | 基因分析平台公测发布 |
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