产品动态

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本文介绍基因分析平台的版本变更信息,包括发布时间、版本变更内容、核心功能特性等信息。

20264

模块

功能项

具体功能项说明

任务投递

投递模板

【优化】现在支持每页展示 500 或 1000 条数据,弹窗高度将随数据量自动调整,浏览更高效。 体验路径:启动模板 > 分析实体 > 选择数据。

20262

模块

功能项

具体功能项说明

日志管理

实时日志

【优化】调整实时日志截断策略,任务运行中查看实时日志较以前可展示更多信息。

202512

模块

功能项

具体功能项说明

应用配置

运行时属性

【新增】runtime中新增shm_mb字段支持自定义共享内存(shm)大小。

工作空间

表格

【优化】取消工作空间表格列数限制,支持全量展示。

202511

模块

功能项

具体功能项说明

应用配置

运行时属性

【新增】 runtime 中新增oss_cache参数支持自定义oss缓存空间大小,加速挂载模式下大文件缓存效率。

任务投递

批量终止

【优化】优化批量终止逻辑,状态更新更及时,提升终止效率。

20258

模块

功能项

具体功能项说明

任务管理

子工作流

【优化】优化子工作流状态同步,复杂任务流转可靠性提升

任务管理

任务详情

【优化】在任务列表点击指定任务查看详情修改为新标签页打开,保留当前列表状态。

20257

模块

功能项

具体功能项说明

任务管理

终止任务

【优化】终止任务增加二次确认,提示日志及输出结果丢失风险。

20254

模块

功能项

具体功能项说明

任务管理

任务详情

【优化】WDL语法错误返回增加上下文提示,帮助定位问题。

20253

模块

功能项

具体功能项说明

应用配置

运行时属性

【新增】runtime中支持timeout参数设置任务最大执行时间,超时自动终止并在控制台报错。

20251

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

运行配置

数据加载模式

挂载

【优化】数据加载模式选择挂载模式下挂载数量超限时自动切换下载模式,避免任务失败。

运行配置

数据加载模式

下载

【优化】优化下载节点断点续传校验与重试,兼容网络异常,提升大文件传输成功率。

202412

模块

功能项

具体功能项说明

任务管理

取消任务

【优化】取消任务跳过结果上传,快速结束。

运维管理

实时日志

【优化】重构实时日志架构,避免客户频繁打印或大日志导致计算性能下降。

应用管理

WDL

【新增】扩展 WDL对文件夹的支持,识别file类型斜杠结尾路径自动判定为目录。

202411

模块

功能项

具体功能项说明

应用管理

WDL

【新增】支持跨工作空间导入 WDL 应用。

202410

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用仓库

全基因组选择

damo/genomic-selection-dataset

【新增】全基因组选择算法数据集构建

damo/genomic-selection-train

【新增】全基因组选择算法模型训练

damo/genomic-selection-pred-self

【新增】全基因组选择算法自交系表型预测

damo/genomic-selection-pred-f1

【新增】全基因组选择算法杂交F1代表型预测

20249

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用配置

创建应用(WDL)

runtime

【新增】支持runtime中同时指定多个规格的机器,如type=gc6.small,gc5.medium,gc4.medium

【新增】支持runtime中直接声明磁盘大小(此时默认使用nas_cap数据盘类型)

【新增】runtime中支持cloud_essd、cloud_essd_pl1、nas_per、nas_cap四种数据盘类型

【新增】runtime中支持通过env指定挂载oss bucket(兼容挂载同账号和跨账号的oss bucket)

【新增】runtime中支持设置sentieon license环境变量的方式使用sentieon

运行选项设置

【新增】支持选择数据加载模式为挂载或下载(前端默认挂载)

应用仓库

变异分析

sentieon

【更新】sentieon需要通过设置sentieon license环境变量的方式继续使用

序列比对

damo/vardict

【新增】CPU并行加速的vardict

damo/bwa-mem2

【新增】基于云优化的bwa-mem2

damo/bwa-mem2-index

【新增】bwa-mem2索引构建

damo/blastn

【新增】基于云优化的blastn

damo/blastn-makedb

【新增】blastn数据库构建

20248

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用仓库

序列比对

damo/align-markdup-bqsr

【新增】GPU版本序列比对排序去重bqsr

变异识别

damo/haplotype-calling

【新增】GPU版本HaplotypecCaller

序列压缩

damo/fqcompress

【新增】高压缩比的fastq压缩

damo/fqdecompress

【新增】高压缩比的fastq解压

变异识别索引

damo/dna-index

【新增】GPU变异分析流程索引构建

20246

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用仓库

群体变异识别

damo/dna-variant-calling

【新增】GPU变异分析流程

damo/joint-calling

【新增】CPU+GPU群体变异分析流程

20215

发布时间

版本变更内容

核心功能特性

2021-05-28

基因分析平台公测发布

  • 生信流程开发、版本化管理和计算分析,支持WDL语言标准

  • 无服务基因计算引擎,支持任意规模样本数据处理

  • 支持CPU/MEM细粒度计算资源,智能计算调度

  • 集成Sentieon第三方商业软件,提供DNAseq,Joint Calling等公共流程