产品动态

本文介绍基因分析平台的版本变更信息,包括发布时间、版本变更内容、核心功能特性等信息。

2024年10月

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用仓库

全基因组选择

damo/genomic-selection-dataset

【新增】全基因组选择算法数据集构建

damo/genomic-selection-train

【新增】全基因组选择算法模型训练

damo/genomic-selection-pred-self

【新增】全基因组选择算法自交系表型预测

damo/genomic-selection-pred-f1

【新增】全基因组选择算法杂交F1代表型预测

2024年9月

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用配置

创建应用(WDL)

runtime

【新增】支持runtime中同时指定多个规格的机器,如type=gc6.small,gc5.medium,gc4.medium

【新增】支持runtime中直接声明磁盘大小(此时默认使用nas_cap数据盘类型)

【新增】runtime中支持cloud_essd、cloud_essd_pl1、nas_per、nas_cap四种数据盘类型

【新增】runtime中支持通过env指定挂载oss bucket(兼容挂载同账号和跨账号的oss bucket)

【新增】runtime中支持设置sentieon license环境变量的方式使用sentieon

运行选项设置

【新增】支持选择数据加载模式为挂载或下载(前端默认挂载)

应用仓库

变异分析

sentieon

【更新】sentieon需要通过设置sentieon license环境变量的方式继续使用

序列比对

damo/vardict

【新增】CPU并行加速的vardict

damo/bwa-mem2

【新增】基于云优化的bwa-mem2

damo/bwa-mem2-index

【新增】bwa-mem2索引构建

damo/blastn

【新增】基于云优化的blastn

damo/blastn-makedb

【新增】blastn数据库构建

2024年8月

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用仓库

序列比对

damo/align-markdup-bqsr

【新增】GPU版本序列比对排序去重bqsr

变异识别

damo/haplotype-calling

【新增】GPU版本HaplotypecCaller

序列压缩

damo/fqcompress

【新增】高压缩比的fastq压缩

damo/fqdecompress

【新增】高压缩比的fastq解压

变异识别索引

damo/dna-index

【新增】GPU变异分析流程索引构建

2024年6月

模块

功能项

子功能点

具体功能项说明

应用仓库

群体变异识别

damo/dna-variant-calling

【新增】GPU变异分析流程

damo/joint-calling

【新增】CPU+GPU群体变异分析流程

2021年5月

发布时间

版本变更内容

核心功能特性

2021-05-28

基因分析平台公测发布

  • 生信流程开发、版本化管理和计算分析,支持WDL语言标准

  • 无服务基因计算引擎,支持任意规模样本数据处理

  • 支持CPU/MEM细粒度计算资源,智能计算调度

  • 集成Sentieon第三方商业软件,提供DNAseq,Joint Calling等公共流程